Diseño, montaje y verificación de una nanoestructura de Origami de ADN 2D (4 / 9 paso)

Paso 4: Ordenar ADN y Kit de montaje

Ahora que habíamos diseñado, visualizar y simular la nanoestructura, queríamos construirlo! Antes de que pudiéramos entrar en el laboratorio, que necesitábamos para la química correcta y ADN. Hoy en día, Origami de ADN puede ser construida a través de un kit que facilita realmente el proceso.

Filamento de la DNA y Kit de montaje de andamios

Pedimos el kit andamio y Asamblea de Nanosistemas Tilibit en Munich, Alemania. Utilizamos el standardt M13mp18 andamio ADN que se encuentra en plegables kit básico, tipo p7249 y costos ~ 140 € ($150).

El contenido del kit plegable básico, son tipo p7249

  • 500 μl 100 nM monocatenario andamio ADN, bases de longitud 7249
  • 500 μl tilibit 10 x plegable tampón XM
  • 500 μl solución 200 mM MgCl2
  • 600 μl tilibit 6 x gel colorante de carga

El kit es bueno para las reacciones de 25. Nota que el plegamiento del almacenador intermediario aquí es esencialmente el mismo como Tampón TAE.

ADN de filamento de grapa

Ordenamos que la grapa está parado de la IDT DNA. Para nuestro diseño, 111 líneas discontinuas se ordenaron como 111 x 25 nmole secado pellets en placas de 2 x 96 pocillos para $770,07 en 24 de julio de 2015 y llegaron el 29 de julio de 2015. Estas muestras se necesitarán se resuspendió en agua MQ durante el montaje. El ADN llegó y se almacenó a-20 ° C. Estos 111 soportes básicos se encuentran en el archivo CSV creado por cadnano. Ordenar es tan simple como copiar + pegar secuencias de este archivo en el portal IDT.

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